2011年3月，環保部再次會同發改委、水利部等有關部委組成10個考核組，分別對重點流域22個省、自治區、直轄市水污染防治專項規劃2010年度實施情況和“十一五”總體實施情況進行考核。黃河流域水資源保護局第三次代表水利部作為考核組成員，對青海、甘肅、寧夏和內蒙四省(區)水污染防治情況考核。
在2011年的考核工作中，水資源保護局考核組成員依據已有的流域水質監測成果，結合多年來取得的工作經驗，針對省(區)存在問題提出了多項可行性意見和建議，得到了流域省區及考核組成員的高度重視。
為全面、科學、公正地做好重點流域水污染防治考核工作，在10個考核組開展現場考核的同時，環保部又通過水利部協助評估《國家環境保護“十一五”規劃》實施情況，黃河流域水資源保護局結合流域水資源保護職能，完成了《關于<國家環境保護“十一五”規劃>黃河流域實施情況評估的報告》，闡述了流域機構貫徹實施《國家“十一五”水污染防治規劃》所開展的工作及取得的經驗，并對存在問題提出了中肯的建議。
截至目前，黃河流域水資源保護局所提意見和建議已被省(區)接收和采納，并得到了環保部和水利部的肯定和認可。此次考核結果將由環保部會同發改委、水利部、監察部、財政部和住房城鄉建設部匯總后上報國務院，經國務院同意后，將交由干部主管部門，按照中組部印發的《體現科學發展觀要求的地方黨政領導班子和領導干部綜合考核評價試行辦法》的規定，作為對各省、自治區、直轄市人民政府領導班子和領導干部綜合考核評價的重要依據。
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